42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0607 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  61.15 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  45.45 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  37.88 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  32.19 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  35.34 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  41.27 
 
 		 189 aa  48.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  33.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  53.49 
 
 		 722 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  32.56 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  31.62 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  36.07 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  48.84 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  48.84 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  48.84 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  53.49 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  53.49 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  48.84 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  53.49 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  31.09 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  32.18 
 
 		 210 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  46.51 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  46.51 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  46.51 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  26.32 
 
 		 137 aa  43.5  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  32.79 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  27 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  45 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  34.55 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  35.94 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  35.59 
 
 		 215 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  35.9 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  38.6 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  40.35 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  40.85 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  33.87 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  46 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  46.51 
 
 		 163 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  49.12 
 
 		 124 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  26.77 
 
 		 151 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  37.84 
 
 		 168 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  33.85 
 
 		 186 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>