16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3494 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  100 
 
 
163 aa  332  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  26.11 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  37.5 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  41.07 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  28.92 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  32.77 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  28.57 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  38.1 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  35.71 
 
 
177 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  24.86 
 
 
186 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  36.21 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1519  TadE-like  44 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  27.85 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  34.92 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  28 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  35.19 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>