49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2979 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  100 
 
 		 185 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  46.89 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  43.27 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  43.4 
 
 		 181 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  44.03 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  41.58 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  41.94 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  33.91 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  39.1 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  33.14 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  34.74 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  38.54 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  39.77 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  35.57 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  36.26 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  34.55 
 
 		 210 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  34.22 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  32.67 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  33.53 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  27.84 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  35.81 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  30.73 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  35.09 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  31.61 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  33.14 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  30.21 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  28.8 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  29.83 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  30.94 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  32.97 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  35.43 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  32.75 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  37.04 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  28.92 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  29.65 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  30.71 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  41.54 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  39.34 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  37.14 
 
 		 722 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  24.68 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  31.58 
 
 		 148 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  34.55 
 
 		 151 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  51.11 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  35.35 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  38.6 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  40.68 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1103  TadE family protein  24.57 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576776  normal  0.446021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>