81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4196 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  100 
 
 		 177 aa  360  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  71.19 
 
 		 181 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  67.23 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  60.95 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  61.84 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  56.83 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  50.9 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  43.27 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  41.81 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  43.9 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  41.34 
 
 		 192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  39.39 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  35.67 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  34.03 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  31.72 
 
 		 207 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  33.14 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  31.98 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  32.45 
 
 		 211 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  31.91 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  32.98 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  36.93 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  32.68 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  29.17 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  30.26 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  33.7 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  27.27 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  28.89 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  29.59 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  29.59 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  29.44 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  28 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  28.81 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2053  hypothetical protein  29.7 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.678498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  28.25 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0400  hypothetical protein  29.7 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  25.88 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  45.76 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  45.76 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  46.94 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42.86 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  26.11 
 
 		 174 aa  50.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  31.76 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  40.32 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  40.32 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  40.32 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  40.32 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  40.32 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  40.32 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  28.44 
 
 		 135 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  42.37 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  41.38 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  35.71 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  36.92 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  32.89 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  29.59 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  37.93 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  38.6 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  24.2 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  29.36 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  36.84 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  42.55 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  24.16 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  37.1 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  29.21 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3201  TadE family protein  25.16 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.517577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  40.82 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  42.55 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  38.3 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  24.41 
 
 		 151 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  25.69 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  42.55 
 
 		 153 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  27.66 
 
 		 157 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  41.67 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  41.67 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  38.78 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0055  TadE family protein  42.55 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.258579  normal  0.372833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2343  hypothetical protein  30.65 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  29.76 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  42.22 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>