76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0396 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  74.47 
 
 
186 aa  278  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  60.34 
 
 
181 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  59.56 
 
 
181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  56.83 
 
 
177 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  63.98 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  41.58 
 
 
185 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  45.5 
 
 
176 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  40.48 
 
 
183 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  40.68 
 
 
192 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  35.87 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  31.4 
 
 
176 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  30.81 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  34.85 
 
 
193 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  31.52 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  33.92 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  37.22 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  28.65 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  30.54 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  29.67 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  28.57 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  30.21 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  31.75 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  26.84 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  29.44 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  29.02 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  29.83 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  28.4 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  28.8 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  28.8 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  48.21 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  48.21 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  48.15 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  25.27 
 
 
182 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  46.43 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3442  hypothetical protein  25.97 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0907712  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  46.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  46.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  46.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  46.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  49.06 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  46.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  46.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  44.12 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  42.62 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  25.71 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  27.51 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  39.06 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  28.57 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  68.42 
 
 
145 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  27.51 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  28.9 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  55.56 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  50 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  27.83 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2053  hypothetical protein  27.49 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.678498  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  30.77 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0400  hypothetical protein  27.49 
 
 
185 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  30.46 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  51.11 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  33.82 
 
 
138 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  37.5 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  25.7 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  26.79 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  45.65 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  47.83 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  43.75 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  41.27 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  46.67 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  43.75 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  25.17 
 
 
160 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  40.43 
 
 
143 aa  42  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  44.74 
 
 
171 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  42.22 
 
 
179 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  38.33 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  44.93 
 
 
204 aa  40.8  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>