15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0612 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  100 
 
 		 163 aa  333  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06189  hypothetical protein  35.06 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03345  hypothetical protein  37.27 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0376  membrane associated secretion system protein  24.05 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.035818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0595  TadE-like family protein  24.18 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0264  hypothetical protein  23.53 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000101731  hitchhiker  0.00000909351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  41.82 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0678  TadE family protein  23.53 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  24.65 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  24.54 
 
 		 179 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  37.04 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  28.87 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  28.23 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  36.84 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  25.81 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>