40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4863 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  100 
 
 		 176 aa  353  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  87.5 
 
 		 176 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  39.39 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  38.1 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  33.52 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  33.91 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  34.73 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  35.33 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  30.12 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  34.32 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  31.4 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  34.9 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  32.68 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  30.05 
 
 		 211 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  31.09 
 
 		 210 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  30.32 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  29.05 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  29.55 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  29.89 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  30.18 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  28.57 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  27.37 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  23.84 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  25 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  25 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  32.42 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  24.28 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  26.9 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  26.4 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  25.95 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  24.57 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  30.98 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  37.5 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  24.86 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  24.28 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  36.07 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  52.5 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  23.12 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  24.14 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  36.84 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>