33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0226 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  60.32 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  59.79 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  47.57 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  31.52 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  34.02 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  32.67 
 
 		 185 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  33.33 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  30.96 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  31.41 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  29.9 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  30.48 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  27.14 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  29.24 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  28.65 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  33.16 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  32.68 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  29.89 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  29.76 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  29.19 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  29.33 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  36.56 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  25.27 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  25.84 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  27.81 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  27.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  30.53 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  32.56 
 
 		 140 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  26.26 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  26.26 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  34.33 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  37.36 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  24.48 
 
 		 193 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>