30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0542 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  43.33 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  36.93 
 
 		 197 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  36.93 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  34.86 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  32.97 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  34.59 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  30.35 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  33.53 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  31.61 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  27.27 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  27.27 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  32.26 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  28.32 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  27.78 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  29.02 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  24.28 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  28 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  24.28 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  29.82 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  28.87 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  28.12 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  31.35 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  27.37 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  30.43 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  32.26 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  32.26 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  27.41 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  29.55 
 
 		 183 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  24.48 
 
 		 207 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>