24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3513 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  98.98 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  75 
 
 		 177 aa  279  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  43.43 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  36.93 
 
 		 193 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  32.51 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  35.03 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  32.76 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  30.21 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  28.65 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  25 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  30.9 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  29.59 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  26.97 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  28.8 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  22.94 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  29.21 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  26.92 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  28.25 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  26.71 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  27.27 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  31.91 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  26.26 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  26.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>