35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0718 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  38.51 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  27.89 
 
 
211 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  28.27 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  29.65 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  29.48 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  31.03 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  28.49 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  25.88 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  29.17 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  33.33 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  30.21 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  28.8 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  23.84 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  23.84 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  29.65 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  26.75 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  25.57 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  29.7 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  26.78 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  37.88 
 
 
140 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  50 
 
 
140 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  32.1 
 
 
207 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  41.18 
 
 
135 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  37.04 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  30.53 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  37.65 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  27.78 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  30.3 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  50 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  27.01 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  22.99 
 
 
191 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  34.21 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  23.63 
 
 
193 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>