37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4198 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  41.21 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  36.07 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  34.29 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  38.73 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  33.17 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  37.57 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  37.22 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  36.92 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  34.52 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  38.86 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  36.93 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  31.37 
 
 		 210 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  33.33 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  33.85 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  30.18 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  28.99 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  34.55 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  34.62 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  32.18 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  35.35 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  31.35 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  28.49 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  32.73 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  31.58 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  42.19 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  29.61 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  31.96 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  25.47 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  24.69 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  28.31 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  38.4 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  35.44 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  29.73 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  35.11 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  42.42 
 
 		 140 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>