31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2732 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  100 
 
 
162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1103  TadE family protein  67.11 
 
 
164 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576776  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  55.83 
 
 
163 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  26.09 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  34.51 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  30.23 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  27.83 
 
 
189 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  28 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  43.14 
 
 
140 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  28.57 
 
 
192 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  25.15 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  30.17 
 
 
167 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  27.85 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  26.06 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  26.55 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4399  TadE family protein  24.24 
 
 
208 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1267  TadE family protein  27.97 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.131769 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  37.7 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  37.7 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  37.7 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  28.38 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  26.42 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  43.14 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  34.55 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  31.58 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  34.62 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2686  hypothetical protein  24.84 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  37.7 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  26.39 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  27.66 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>