13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1267 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1267  TadE family protein  100 
 
 		 175 aa  356  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  93.14 
 
 		 175 aa  335  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  38.67 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  35.37 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31.33 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  31.91 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4159  TadE family protein  33.58 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  33.33 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  30.83 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0055  TadE family protein  44 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.258579  normal  0.372833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  43.75 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  42.22 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>