53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0584 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  67.28 
 
 		 163 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  41.9 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  41.9 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  44.79 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  41.34 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  44.91 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  41.34 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  41.34 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  41.34 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  40.45 
 
 		 722 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  41.9 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  42.13 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  40.45 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  40.34 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  39.39 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  30.26 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  30.73 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  33.59 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  36.08 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  28.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  30.53 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  35.29 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  41.18 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  41.18 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  41.18 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  28.46 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  36.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  28.32 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  38.36 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  45.1 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  33.91 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  32.94 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  28.57 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  32.64 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  48.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  35.06 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  35.06 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  39.22 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  39.22 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  37.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  27.94 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  27.61 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  58.33 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  43.86 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  35.94 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  48.89 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  34.62 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  37.21 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  32.81 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  38.3 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  37.88 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  34.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>