52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1103 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1103  TadE family protein  100 
 
 		 164 aa  331  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576776  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  67.11 
 
 		 162 aa  203  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  58.71 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  32.43 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  48.94 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  30.77 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  22.09 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  37.1 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  24.57 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  54.05 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  33.71 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  28.95 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  29.31 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  38.78 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  40.43 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  40.74 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  30 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  25 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  23.4 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  43.4 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4122  TadE family protein  32.71 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  37.74 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  25.77 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3201  TadE family protein  30.83 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.517577 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  32.58 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  32.58 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  32.58 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  30.11 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.31 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1267  TadE family protein  26.32 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  31.75 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  45.65 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  26.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  33.8 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  33.75 
 
 		 278 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  36.36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  25.58 
 
 		 130 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  37.93 
 
 		 148 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  22.3 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  40.38 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  27.34 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  35.29 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  28.57 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  35.09 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  35.29 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  22.7 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  40.38 
 
 		 136 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.58 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  22.7 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  29.37 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  22.7 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  27.01 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>