31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5559 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  41.36 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  38.62 
 
 
207 aa  121  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  37.99 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  33 
 
 
197 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  34.59 
 
 
193 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  32.51 
 
 
197 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  30.77 
 
 
177 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  33.87 
 
 
181 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  34.72 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  33.16 
 
 
177 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  31.75 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  34.18 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  28.65 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  27.37 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  32.26 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  31.98 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  27.37 
 
 
176 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  32.97 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  28.42 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  29.79 
 
 
176 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  36.68 
 
 
191 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  32.48 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  27.62 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  28.04 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  26.7 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  26.15 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  34.33 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  31.37 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  33.33 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  35.59 
 
 
140 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>