34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0800 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  41.21 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  41.86 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  41.34 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  39.57 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  40.8 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  40.68 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  42.5 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  41.62 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  35.78 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  35.57 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  34.32 
 
 		 176 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  34.1 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  32.62 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  36.42 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  31.72 
 
 		 210 aa  97.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  33.7 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  33.14 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  29.9 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  31.64 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  28.57 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  30.29 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  28.65 
 
 		 215 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  27.27 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  28.65 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  28.09 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  30.3 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  25.57 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  26.86 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  26.97 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  32.18 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  28.33 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3442  hypothetical protein  24.73 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0907712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  24.86 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>