25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2152 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0400  hypothetical protein  40.96 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2053  hypothetical protein  40.96 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.678498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  36 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3442  hypothetical protein  35.36 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0907712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  34.34 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  28.89 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  26.34 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  28.24 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  26.97 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  25.27 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  29.7 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2153  hypothetical protein  32.35 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0419254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  27.37 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  24.86 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  37.04 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  22.68 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  25.84 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  29.87 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  22.95 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  40.91 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  51.52 
 
 		 204 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  31.58 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  28 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  44.12 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>