15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0837 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2053  hypothetical protein  45.24 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.678498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0400  hypothetical protein  44.64 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  38.04 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3442  hypothetical protein  32.97 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0907712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  34.3 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  28.33 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  29.71 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  29.28 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  26.7 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  25.43 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  28.81 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  24.86 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  26.14 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  23.9 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>