34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0226 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  43.98 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  43.53 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  43.9 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  42.11 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  39.61 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  40.48 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  39.16 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  41.62 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  33.52 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  33.52 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  39.1 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  30.39 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  33.91 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  30.48 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  34.29 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  37.13 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  27.14 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  34.69 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  30.34 
 
 		 204 aa  84.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  25.88 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  30.59 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  32.97 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  30.56 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  29.82 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  28.24 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  28.25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  28.25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  27.72 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  27.01 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  27.07 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  25.53 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  25.53 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  27.15 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>