34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2389 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  70.62 
 
 		 193 aa  271  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  39.38 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  38.1 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  37.11 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  36.02 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  34.07 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  34.3 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  34.62 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  33.33 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  33.69 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  36.26 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  33.15 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  33.14 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  31.22 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  32.07 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  34.36 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  28.95 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  32.99 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  32.97 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  33.7 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  31.91 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  34.82 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  31.55 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  27.8 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  27.67 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  27.08 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  36.54 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  33.33 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  26.2 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  26.4 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  30.39 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  29.41 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  42.65 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>