30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3347 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  51.96 
 
 		 211 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  52.63 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  47.57 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  34.33 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  34.22 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  34.9 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  33.33 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  36.92 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  33.33 
 
 		 176 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  30.34 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  30.27 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  30.27 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  28.49 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  30.85 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  29.94 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  30.26 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  28.57 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  26.84 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  27.49 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  27.27 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  27.98 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  30.24 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  39.53 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  26.04 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  27.46 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  28.49 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  41.94 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  27.41 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  27 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>