39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0414 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  43.98 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  42.37 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  42.26 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  41.81 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  41.94 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  40.26 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  39.64 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  40.8 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  35.87 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  30.12 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  31.58 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  33.73 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  34.33 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  30.57 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  28.57 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  36.07 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  34.36 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  31.35 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  33.87 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  30.48 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  31.03 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  32.78 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  27.32 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  27.32 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  28.8 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  26.98 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  28 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  28.42 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  29.94 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  27.27 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  27.27 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  33.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  22.95 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  27.54 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  43.14 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  35.94 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  29.77 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>