59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7024 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  71.6 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  66.67 
 
 		 181 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  60 
 
 		 177 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  63.54 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  64.16 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  50.9 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  39.64 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  43.86 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  40 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  41.24 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  33.53 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  33.33 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  32.93 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  31.38 
 
 		 207 aa  97.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  34.54 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  31.53 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  32.94 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  30.05 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  29.85 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  28.09 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  33.16 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  28.95 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  30.53 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  36.26 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  30.81 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  27.57 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  28.65 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  27.12 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  27.12 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  28.11 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  24.28 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  25.14 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3442  hypothetical protein  24.58 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0907712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  35.62 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  24.55 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  25.88 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  41.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  41.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  41.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  28.09 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  34.18 
 
 		 134 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2273  TadE-like protein  25.69 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  39.34 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  41.82 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  36 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  30 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  40.85 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  28.57 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  32.89 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  36.11 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  38.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  38.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  38.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  38.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  27.37 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  38.6 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>