33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1665 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  34.86 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  44.83 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  31.06 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  46.77 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  54.17 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  54.17 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  54.17 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  32.45 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  34.04 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  51.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  51.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  28.85 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  51.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  51.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  51.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  51.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  31.47 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42.86 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  32.3 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  39.66 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  29.53 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  29.59 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  29.01 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  37.04 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  37.93 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  37.5 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  40 
 
 
153 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  32.93 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  38.33 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  38.46 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  33.96 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  25.44 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>