38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0638 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  100 
 
 		 146 aa  289  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  55.48 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  54.79 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4834  hypothetical protein  57.45 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.655399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  40.69 
 
 		 168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  40.76 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  36.55 
 
 		 160 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  36.08 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  33.02 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  43.75 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  43.75 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  43.75 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  43.75 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  32.21 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  36.78 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  30.43 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  30.13 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  39.22 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  39.22 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  39.22 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  28.86 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  28.86 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  29.41 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  37.04 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  36 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  26.95 
 
 		 146 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  24.49 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  29.75 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  25.86 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  25.76 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  30.77 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  32.14 
 
 		 140 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>