65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1441 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  100 
 
 		 168 aa  331  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  77.98 
 
 		 167 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  42.11 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  40.85 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  40.85 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  40.85 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  40.85 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  40.85 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  40.85 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  43.21 
 
 		 155 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  38.82 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  42.86 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.03 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.03 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.03 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  37.74 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  38.51 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  38.51 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  50.67 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  53.33 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  37.11 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  60 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  35 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  34.01 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  44.83 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  41.57 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  49.02 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  36.78 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  46.81 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  55.56 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  46.97 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  41.67 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  36.56 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  35.59 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  48 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  44.64 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  36.8 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.73 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  41.67 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  47.83 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  52.11 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  45.45 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  44.68 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  40.74 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  35.19 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  41.18 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  42.55 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.86 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  44.44 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  46.81 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  44.44 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  36 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  40.74 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  40 
 
 		 181 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  29.31 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  29.31 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  41.18 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  40 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  40 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  41.82 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  41.67 
 
 		 336 aa  40.8  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  35 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  26.71 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  27.18 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>