74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1039 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  100 
 
 		 164 aa  324  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  100 
 
 		 164 aa  324  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  98.78 
 
 		 164 aa  321  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  89.02 
 
 		 164 aa  258  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  64.71 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  64.71 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  64.71 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  64.71 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  64.71 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  64.71 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  64.71 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  55.9 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  45.06 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  46.36 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  41.52 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  42.24 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  41.14 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.1 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  42.76 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  39.33 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  33.54 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  31.61 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  30.86 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  34.53 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  33.99 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  29.68 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  32 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  32.89 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  27.63 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  44.16 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  27.39 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  28.44 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  27.15 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  43.08 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  40.62 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  42.37 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  50 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  39.29 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  44.68 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  42.31 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.79 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  43.33 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  38.51 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  38.51 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  26.52 
 
 		 129 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  29.86 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  44.9 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  45.65 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  44.9 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  29.93 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  25.48 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  30.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  51.06 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  42 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  38.18 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  28.42 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  40.43 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  35.85 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  45.1 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  36.54 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  30 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  43.18 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  33.78 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  39.58 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  30.86 
 
 		 170 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32.73 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  25.16 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  35.71 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  27.85 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  30.14 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  39.58 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  37.5 
 
 		 336 aa  40.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  40.91 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>