39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1342 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  100 
 
 		 175 aa  356  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  50 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  38.35 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3156  TadE-like  38.06 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  42.31 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3505  TadE family protein  35.88 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  34.74 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2135  TadE family protein  43.04 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546048 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  42.86 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  42.86 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.59 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  30.6 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  41.07 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1101  TadE-like protein  40.86 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  31.3 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  46 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  44.44 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  39.74 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  44.07 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  44 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  34.43 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  39.66 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  40.26 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  44 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  40.32 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  31.71 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  28.87 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  41.27 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  43.14 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  27.27 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  37.04 
 
 		 156 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  29.21 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>