29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4199 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  40.32 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  34.88 
 
 
187 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  29.24 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  34.1 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  29.82 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  29.8 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  28.32 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  30.3 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  29.71 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  28.07 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  29.59 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  27.33 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  27.49 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  30.99 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  27.22 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  25.57 
 
 
242 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  28.07 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  28.7 
 
 
219 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  23.47 
 
 
229 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  24.24 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  21.12 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  28.82 
 
 
178 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  28.82 
 
 
178 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  43.1 
 
 
129 aa  44.7  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  37.04 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  37.04 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  37.04 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.428289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>