13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0401 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  361  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  361  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2153  hypothetical protein  35.06 
 
 		 201 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0419254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2269  hypothetical protein  34.08 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.783981 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0836  hypothetical protein  33.9 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.389481  normal  0.670982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3443  hypothetical protein  35.47 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.142737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  28.49 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  31.78 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  29.44 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  28.82 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  25.99 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  22.52 
 
 		 193 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  24.32 
 
 		 193 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>