30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0228 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  50.56 
 
 		 193 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  48.89 
 
 		 193 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  40.34 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  33.16 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  30.73 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  31.55 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  30.22 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  30.82 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  27.22 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  29.95 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  29.22 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  26.55 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  26.49 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  27.74 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  30.36 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  31.78 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  31.78 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  23.86 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0836  hypothetical protein  27.43 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.389481  normal  0.670982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  27.01 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  26.09 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  27.59 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  27.59 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  28.36 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>