36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2327 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  34.03 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  36.05 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  42.31 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3156  TadE-like  38.97 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2135  TadE family protein  40 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  31.67 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.27 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3505  TadE family protein  35.34 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  40 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  40 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  40 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  45.83 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  36.14 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  38.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  37.1 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  39.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  39.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  39.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  37.14 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  39.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  39.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  39.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  28.04 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  39.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  29.2 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  45.83 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  30.83 
 
 		 181 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  34.83 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  43.33 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  32.47 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  27.27 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0051  TadE family protein  31.65 
 
 		 139 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.818933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1101  TadE-like protein  38.78 
 
 		 147 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  33.33 
 
 		 140 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>