35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4195 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  71.43 
 
 		 206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  64.58 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  57.67 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  51 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  50.51 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  41.95 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  34.01 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  35.75 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  35.91 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  32.58 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  30.69 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  30.16 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  28.86 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  33.51 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  27.32 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  32.32 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  30 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  29.7 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  25.4 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  28.29 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  33.97 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  28.81 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  25.71 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  30.5 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  24.76 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  51.22 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  50 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  27.8 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  27.47 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  27.47 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  43.1 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  34.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>