28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3512 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  97.03 
 
 		 202 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3897  TadE family protein  84.09 
 
 		 176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  46.67 
 
 		 195 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  41.21 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  34.33 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  29.44 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  31.25 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  29.65 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  26.85 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  28.4 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  25.51 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  26.32 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  24.23 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  26.11 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  25.61 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  26.87 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  27.39 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  29.37 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  20.71 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  30.39 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  27.01 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  21.93 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  27.78 
 
 		 229 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  26.54 
 
 		 166 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>