37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3346 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  47.85 
 
 		 193 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  45.7 
 
 		 193 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  40.64 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  33.51 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  33.53 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  31.36 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  27.72 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  29.3 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  28.72 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  27.07 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  27.62 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  28.41 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  28.11 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  27.59 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  28.19 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  29.45 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  31.32 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  27.56 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  28.42 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  33.55 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  25 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  35.87 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  27.93 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  36.56 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  31.34 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  34.21 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  26.55 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3443  hypothetical protein  25.81 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.142737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  31.11 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0836  hypothetical protein  25.23 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.389481  normal  0.670982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  31.25 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  35.09 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  28.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  28.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  54.55 
 
 		 134 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>