25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4098 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  34.21 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  29.85 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  28.49 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  28.43 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  28.42 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  27.46 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  29.35 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  31.94 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  26.37 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  26.46 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  28.12 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  30.35 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  24.61 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  27.46 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  27.17 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  32.5 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  23.96 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  28 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  29.81 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  21.12 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  26.28 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  25 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  24.84 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  32.69 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>