30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0225 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  40.35 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  40.7 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  34.68 
 
 		 208 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  36.99 
 
 		 242 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  32.22 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  31.18 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  34.88 
 
 		 188 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  34.1 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  35.2 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  31.38 
 
 		 214 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  35.42 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  29.45 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  31.55 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  34.72 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  31.97 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  32 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  31.94 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  27.43 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  32.39 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  30.67 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  29.76 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  25.88 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  30.72 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  28.19 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  28.8 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  28.4 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  26.72 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  28.79 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2497  TadE-like  32.88 
 
 		 221 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0206754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>