33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2390 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  75.13 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  38.65 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  35.35 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  34.27 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  32.98 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  34.48 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  35.15 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  30.35 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  34.13 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  36.2 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  30.72 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  32.3 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  33.12 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  32.05 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  30.28 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  29.65 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  27.06 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  26.8 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  32.88 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  30.36 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  34.88 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  33.71 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3897  TadE family protein  31.77 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  24.65 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  27.59 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  28.83 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0893  hypothetical protein  25.94 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.935843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0932  hypothetical protein  27.8 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.766418  normal  0.967393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2153  hypothetical protein  38.71 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0419254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  34.92 
 
 		 240 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>