34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2821 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  75.48 
 
 		 216 aa  307  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  39.44 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  36.14 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  35.03 
 
 		 195 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  31.96 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  32.68 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  33.77 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  30.54 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  29.49 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  30.67 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  33.17 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  32.72 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  30.82 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  29.22 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  30.81 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  30.25 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  32.65 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  30.38 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  37.11 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  32.39 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  28.3 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3897  TadE family protein  33.85 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  30.77 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  32.95 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  29.66 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  40.91 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  33.07 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  27.38 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  27.72 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0893  hypothetical protein  43.66 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.935843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0932  hypothetical protein  42.86 
 
 		 277 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.766418  normal  0.967393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  26.38 
 
 		 178 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  26.38 
 
 		 178 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>