28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0307 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  76.24 
 
 		 204 aa  314  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  61.88 
 
 		 184 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  57.14 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  48.82 
 
 		 206 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  50.52 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  46.95 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  36.99 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  33.16 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  31.02 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  30.86 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  27.66 
 
 		 182 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  27.78 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  30.26 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  25.57 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  28.9 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  23.96 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  29.35 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  27.06 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  26.49 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  29.33 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  32.05 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  28.38 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  27.01 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  26.79 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  37.18 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  27.39 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  26.39 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>