29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3514 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  76.81 
 
 		 206 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  64.67 
 
 		 208 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  52.58 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  46.95 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  49.01 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  41.71 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  31.18 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  29.67 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  28.65 
 
 		 229 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  28.42 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  29.95 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  34.74 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  30.3 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  30.97 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  26.9 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  28.39 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  35.15 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  29.41 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  29.95 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  26.47 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  26.7 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  29.17 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  26.25 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  28.09 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  26.44 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  27.8 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  25.84 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  25.79 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>