31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2978 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  37.17 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  34.74 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  30.69 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  33.54 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  32.16 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  32.42 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  30.99 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  34.09 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  29.35 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  29.28 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  34 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  31.18 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  30.37 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  32.28 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  30.5 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  34 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  29.53 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  32.31 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  28.67 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  26.21 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  33.7 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  30.28 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  37.27 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  26.99 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  27.5 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  37.1 
 
 		 277 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2272  hypothetical protein  23.44 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.953892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  34.62 
 
 		 168 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  54.84 
 
 		 165 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>