31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5558 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  39.5 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  35.35 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  36.27 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  34.18 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  32.32 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  32 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  34.33 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  34.33 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  30.86 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  28.99 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  29.61 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  28.48 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  28.1 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  26.7 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  32.04 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  28 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  28.48 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3897  TadE family protein  35.83 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  31.13 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  28.7 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  26.01 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  26.79 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  32.12 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  26.09 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  32.28 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  47.62 
 
 		 143 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  30.7 
 
 		 181 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>