33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3505 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3505  TadE family protein  100 
 
 		 137 aa  269  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  36.89 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  34.59 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  41.18 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  35.88 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3156  TadE-like  34.33 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  31.39 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  35.34 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.23 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.23 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.23 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  40.32 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  33.03 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  44.23 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1101  TadE-like protein  47.54 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  32.43 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  40 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  48.94 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  41.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  44.44 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  28.57 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  39.58 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  29.55 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  29.93 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  39.58 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  29.59 
 
 		 135 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>