31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1260 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  100 
 
 
165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  50 
 
 
175 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  40.58 
 
 
146 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3156  TadE-like  40.88 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  34.35 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3505  TadE family protein  34.13 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  33.06 
 
 
138 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2135  TadE family protein  24.14 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.546048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  32.29 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1101  TadE-like protein  30 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  28 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  32.35 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2273  TadE-like protein  26.47 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  37.5 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  31.09 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  22.56 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  37.5 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  35.09 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  33.33 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  44.23 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  32.26 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  33.33 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  35.19 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  36 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>