13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1910 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  100 
 
 		 140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  33.33 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  36.99 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  37.29 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  37.1 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  26.72 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  37.5 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  26.52 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  37.04 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  34.25 
 
 		 128 aa  40.8  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  30.3 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  36.21 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  30.88 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>