16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4700 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  100 
 
 
128 aa  258  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  38.28 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  35.94 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  39.17 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  37.21 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.41 
 
 
137 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  28.26 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  30.49 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  34.25 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  26.47 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  31.67 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  40.91 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  40.91 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  30.77 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  39.13 
 
 
180 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  40.91 
 
 
164 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>