54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1101 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1101  TadE-like protein  100 
 
 
147 aa  285  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  36.07 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3156  TadE-like  37.4 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  30 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  35.2 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  41.13 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  45.35 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  37.37 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  37.35 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  40.86 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  28.89 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.29 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  35.59 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  44.83 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  44 
 
 
164 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44 
 
 
164 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44 
 
 
164 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44 
 
 
164 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  33.33 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  33.33 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  32.1 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  43.86 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  38.46 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  33.33 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  32.97 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  40 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  46 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  36.51 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  32.58 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  37.72 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  30.53 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  35.37 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  36.67 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  41.51 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  36.59 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4120  TadE family protein  38.89 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3505  TadE family protein  42.86 
 
 
137 aa  42  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124271  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  41.18 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  37.25 
 
 
156 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  40.32 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  28.77 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  40.32 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  41.67 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2135  TadE family protein  34.09 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.546048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  37.97 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  48 
 
 
209 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  37.04 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  25.83 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>